En sus inicios fue una Cofradía rica tanto en patrimonio artístico como en propiedades heredadas de los hermanos cofrades. Pero la Guerra de la Independencia ocasionó la pérdida de sus imágenes y gran parte de su archivo. Los esfuerzos de los últimos años han permitido la recuperación de documentos de gran importancia. Es el caso del Libro de Acuerdos y Ordenanzas que data del día 28 de enero de 1674, que recoge el recorrido que debía seguir la Procesión de Nuestro Padre Jesús Nazareno camino del Calvario en la mañana del Viernes Santo. En esa fecha podemos afirmar que, en relación con la comunidad dominica y bajo su patrocinio, está constituida oficialmente la Cofradía.

En cuanto a los pasos, frente a la antigua tradición penitencial que representan las procesiones de crucificados, la Cofradía de Jesús Nazareno aportará a la Semana Santa astorgana, por influencia de modelos vallisoletanos, los grupos escultóricos.

El primer paso documentado, aunque perdido, representaba la Coronación que fue encargado, en 1674, a Jacinto Montenegro. El mismo que realiza un Jesús camino del Calvario. Ambos serían precedente de los actuales.

En 1751 se edifica la capilla de la Cofradía que en el siglo XIX se convertiría en iglesia parroquial de Puerta de Rey.

Un intento de prohibición, en 1786, de la escenificación del Encuentro de Jesús Nazareno y María Santísima, tras la carrera de San Juan, nos hace pensar que existirían imágenes.

A comienzos del siglo XIX, se inicia un proceso de reactivación de las manifestaciones pasionales en general al que no va a ser ajena esta Cofradía, cuyo patrimonio artístico había desaparecido durante la guerra.

En 1815 se encarga el nuevo paso Camino del Calvario, obra que será modificada por Julián López y a la que, en 1829, Francisco López añade el cireneo y los dos sayones.

Es Francisco López, quien realizará una serie de grupos escultóricos cargados de ingenuidad y marcados por la idea de reproducir los destruidos: la Flagelación, Pilatos presentando a Jesús al Pueblo y la Coronación de Espinas; todas obras fechadas en 1829. Encargos realizados en el siglo XIX son también: San Juan Evangelista (1823), Lágrimas de San Pedro (1829), ambas de Francisco López y las imágenes de bastidor de laVirgen Dolorosa y La Verónica. Con esta serie de obras queda conformada la procesión que la Cofradía realiza en la mañana del Viernes Santo.

A principios del siglo XX, el Obispado y el Ayuntamiento de la ciudad proyectan una reorganización y un impulso de la Semana Santa. Se establece un orden en las procesiones especificando los pasos que saldrán. Así, la Cofradía de Nuestro Padre Jesús Nazareno y M. S. de la Soledad saldrá en la mañana del Viernes Santo con la procesión del Encuentro y los pasos antes mencionados. Por la noche, la Cruz Verde, San Juan y la Farola acompañarían a la Virgen de la Soledad en la procesión que lleva su nombre.

En esta etapa de actividad y renovación, la Cofradía introduce nuevos materiales en los pasos. Es el caso del vidrio emplomado utilizado en laCruz Verde y la Farola, realizados en 1909.

Tras el decaimiento de la Semana Santa en general durante las décadas de los años 60 y 70, la Cofradía participará del resurgir de los 90.

En la actualidad cuenta con más de mil cien hermanos. En julio de 1997, S. M. D. Juan Carlos I, Rey de España, aceptó el cargo de Hermano Mayor Honorario de esta Cofradía.